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Jun 27 2011


Observación de microorganismos Diego

Hoy día 27 de Junio de 2011 ha empezado el proyecto Praktikum.

 (Politécnica de la Universitat de Valencia)

En mi caso, me confundí de lugar en el que se nos había citado, pero no pasó nada ya que pronto fuimos (yo y mi tutora, la profesora de biología) al lugar indicado, llegando con cinco minutos de adelanto. Estaba bastante nervioso ya que era una gran experiencia nueva para mí.

En dicho punto de encuentro se nos informó, breve y generalemente, de los grados que se podían cursar en la politécnica, más concretamente aquellas que se podían cursar en la escuela de agronomía y del medio natural, que son la ingeniería forestal, la rural, la tecnología y manipulación de alimentos y la biotecnología. Tras la charla, cada alumno fue con su respectivo tutor para iniciar el proyecto que se le había asignado.

En mi caso, yo soy Diego, y mi trabajo consistía, junto con Borja y bajo la supervisación del tutor Gonzalo, en analizar y estudiar los microorganismos productores de antibióticos.

Al inicio del proyecto, se nos envió al laboratorio de Microbiología, del departamento de Biotecnología. Una vez allí, se nos presentaron las diferentes herramientas de trabajo que íbamos a necesitar: los matraces, las placas, los medios y productos de cultivo, el autoclave,… Que explicaré a lo largo del blog conforme utilize dichas herramientas.

Lo primero era preparar los medios de cultivo: para ello necesitábamos matraces simples, agár (mezclado con nutrientes para los microorganismos), agua, algodón y aluminio. Se trataba de verter agár en el matráz y mezclarlo con agua, en una proporción de 38g por cada 1L de agua; puesto que utilizamos 300ml de agua, utilizamos 11.4g de agár (el agár es una sustancia sólida que se funde a 100ºC, pero que se solidifica a 45ºC. Por ello lo utilizámos para obtener un medio de cultivo sólido posteriormente). Después cubríamos el matráz con el algodón (que no es como el que tú tendrás en casa) y lo volvíamos a cubrir con aluminio. Esta operación sirviría para, tiempo después, tener medios de cultivo en los que colocar los microorganismos.

El matraz se colocaba en una máquina llamada autoclave, que según Gonzalo, es como «una gran olla a presión»: se colocaban los matraces dentro, la máquina los calentaba hasta los 21º durante 20 minutos, y así se esterilizaban los matraces. El autoclave expulsaba 75 L de vapor de agua para empujar y expulsar a su vez los gases que pudiera contener el recipiente. Después, salía agua muy caliente que se encargaba de eliminar los microorganosmos que pudiran estar presentes en los matraces. Todo esto tardaba, junto al proceso de enfriamiento, 1h y 15 min, tiempo que aprovechamos para almorzar en una de las numerosas cafeterías de la politécnica.

 (autoclave)                  (así es como se colocan en el autoclave)

Al volver, Gonzalo nos dió unos medios de cultivo que ya estaban preparados: por un lado, teníamos unas placas petri sin microorganismos (solo con em medio sólido y los nutrientes), y por otro lado, teníamos placas petri con microorganismos que ya habían proliferado. Teníamos que obtener microorganismos de esas placas de manera que estubiesen bien separados. Para ello, cogimos un asa, un mechero (de los gordos, los de laboratorio) y las placas. Primero, esterilizamos el asa colocándolo un tiempo sobre el mechero (encendido, obviamente), después, con dicho asa, cogíamos microorganismos de una de las placas y los repartíamos en un lado de una placa petri sin microorganismos; esto era la primera estría. Luego, volvíamos a esterilizar el asa y repartíamos los microorganismos de la primera estría en una segunda estría, dejando un hueco para poder posteriormente hacer una tercera estría de microorganismos a partir de la segunda, habiendo esterilizado el asa anteriormente. Dejamos esas nuevas cajas petri con microorganismos en un gran recipiente que se mantenía a 28 ºC, recogimos nuestros cultivos que habíamos dejado en el autoclave, para después vertir dichos cultivos (que estaban a 50 ºC) en unas cajas petri vacías y las guardamos en otro recipiente. Para hoy, el primer día, ya era suficiente.

 (medio de cultivo)                     (asa de siembra)

Mientras estábamos en el laboratorio, me gustó mucho ver que estábamos en medio de un grupo de verdaderos profesionales y cómo nos ayudaban en el proyecto. Me impresionó mucho la gran cautela con la que se manejaban los instrumentos, asi como la gran cantidad de reglas higiénicas que había que cumplir en el laboratorio.

Tras el proyecto, nos fuimos a comer en grupo a un establecimiento situado en la parte posterior del edificio en el que trabajamos, y después nos fuimos a una aula de informática donde estoy escribiendo ahora mismo.

Al acabar el horario previsto, me voy al colegio mayor Galileo Galilei, ya que al ser de Alicante no me puedo permitir el lujo de volver a mi casa 🙁

El segundo día, hemos empezado las prácticas directamente, a las 9:15 de la mañana, en el laboratorio. Nos han enseñado cómo hacer una tinción Gram, para colorar micoorganismos (aunque mueran) y poder examinarlos luego por microscopio. Si en el resultado salía un color violeta oscuro, entonces el microorganismo es Gram- positivo (su pared bacteriana es gruesa, y por tanto retiene mejor los colorantes), y si da un color rosa claro, entonces el microorganismo es Gram-negativo (su pared bacteriana es fina). El procedimiento fue el siguiente:

Colocamos sobre una gota de agua destilada microorganismos provenientes de una placa petri en una placa de vidrio mediante un asa convenientemente esterilizada. Después, añadíamos violeta de genciana a la placa, sobre los microorganismos, y esperamos un minuto. Después, lavamos la placa y le colocamos encima lugól, para que el anterior colorante se fije bien a la pared bacteriana. Tras un minuto, se vuelve a lavar (siempre con agua destilada) y le echamos alcohol durante 30 segundos (hay que tener mucho cuidado con este paso, ya que si nos pasamos de tiempo se pueden deformar los resultados). Luego lavamos la placa y le echamos fuscina básica, que se tiene que mantener durante tres minutos. Borja y yo, que somos unos bestias, hemos hecho cuatro placas a la vez, y yo me he manchado el dedo pulgar con violeta de genciana, que resulta que no se fué con lejía, por lo que tendré que esperar varios días para que se me vaya.

Tras esto, secamos las placas usando un mechero (de los de laboratoooooorio). Y así, las placas estaban listas para ser observadas por microscopio. Primero, observamos a 40 aumentos, pero resultó que no era suficiente, teníamos que usar 100 aumentos. A esos aumentos teníamos que usar un aceite de inmersión que englobase en una gota el objetivo y la placa, ya que a esos aumento se debe evitar el índice de refracción. Al ver a los microorganismos, observamos que se dividían en dos tipos: unos microorganismos tenían forma redondeada (que son los llamados cocos) y otros tenían forma de tubo (que son los bacilos).

 (bacilos)    (cocos)

Después de observar las placas, nos tomamos un buen almuerzo en la cafetería del día anterior. Al volver, Gonzalo nos dió una charla muy interesante sobre los proyectos que se estaban realizando en el departamento de Biotecnología.

 (almuerzo)

Resulta que tiene varias líneas de investigación, siendo una de ellas el estudio de microorganismos que pudieran descomponer las aguas residuales. Este proyecto tiene un fuerte apoyo financiero otorgado por los ayuntamientos comaracales (y también del general), ya que les interesa mucho encontrar organismos que puedan descomponer totalmente los resíduos de estas aguas. Otra investigación que están haciendo está relacionada con los fungicidas. Se buscan, a nivel internacional, fungicidas naturales, ya que los sintéticos (los preductos químicos) contaminan muchísimo, no solo al aplicarlos sino también para producirlos. Así pues, se buscan microorganismos (que no sean descubiertos todavía) que puedan eliminar hongos sin ningún peligro. La universidad busca microorganismos en los restos de compost que originan los gusanos, algo que no se está buscando mucho actualmente, por lo que se puede decir que este proyecto de la universidad es original. 

Este proyecto me gusta cada vez más conforme vamos avanzando, estamos descubriendo nuevas técnicas biotecnológicas (tanto las tradicionales como las nuevas) que nos permiten obtener muy buenos resultados. Nunca se sabe lo que haremos el día después XD.

Día 3,  hoy nos hemos dedicado casi completamente a la extracción del DNA de los microorganismos. Para empezar teníamos que prepara lysozyma (que parece ser que se extrae de yema de huevo), pero por suerte ya estaba preparada, por lo que pudimos saltartnos este paso. Luego debíamos echar los microorganismos en un tubo pequeñito, y mezclarlo con el lysozyma, utilizando una máquina (el vórtice) en la cual simplemente había que colocar la punta del tubo sobre el vórtice y aguantar el tubo mientras la máquina vibraba y mezclaba los componentes. Seguidamente teníamos que colocar el tubo en otra máquina que permitiía mantenerlo a 37ºC, durante treinta minutos, tiempo que aprovechamos para almorzar.

Cuando ya estaban preparados los tubos, teníamos que echar a la mexcla unos 200 microlitros de proteína K, más otros 200 microlitros de «Lysis Solution», y mezclar, usando el vórtex, durante 15 segundos. Después teníamos que prepara unas columnas (que son unos tubos dentro de otros tubos) para echar la disolución resultante (tras haber debidamente lavado el tubo centrifugándolo). A esta disolución le echamos unos 200 microlitros de etanol y lo mezclamos con el vórtex durante unos diez segundos. Luego echamos el tubo en una centrifugadora, y cambiamos de recipiente para quedarnos con la columna y eliminar los restos originados. Esto lo volvimos a hacer dos veces, pero mezclando cada vez la disolución con una disolución de lavado. Por último, echamos 200 microlitros de «Elution Solution» en el centro de la columna y volvimos a centrifugar. Tras eliminar los restos, guardamos el DNA (que ya estaba bastante puro) en la «nevera».

(pipeta)              (procesos de la extracción)

Este proceso nos ha llevado casi todo el tiempo del proyecto de hoy, y hasta hemos tenido que almorzar antes ya que todos los pasos deben estar perfectamente encadenados. Por suerte, Gonzalo nos había dado el día anterior unas hojas (en inglés) en las que ya ponía cómo iba a ser la extracción del DNA.

Al acabar esto, descansamos una media hora leyendo unos artículos (otra vez en inglés) sobre avances de biotecnología en el mundo actual. Pero rápidamente seguimos con nuestro proyecto: eb el poco tiempo que nos quedaba, teníamos que hacer un gel en el cual se pudiese incluír el ADN, para después examinarlo con luz ultravioleta. Pero hoy solo hicimos el gel, utilizando un líquido llamado TAE (que seguramente serán las iniciales de un nombre mucho más complicado), mezclándolo con una sustancia parecida al agar, y que curiosamente teníamos que apartarnos de la luz ya que la solución era sensible a ésta.

Pero hoy nos enfrentamos a un gran problema: no tenemos ni idea de cómo hacer la presentación de la semana que viene. Se nos había ocurrido hacer un par de vídeos en los que Borja y yo nos turnábamos para grabar los diferentes pasos del proyecto. Por desgracia, la cámara no era buena, y ninguno de nosotros teníamos ni idea de cómo manejar el vídeo en el ordenador, por lo que la duda quedaba aún en el aire.

Este es el penúltimo día del proyecto, lo cual es una pena porque me ha gustado mucho esta experiencia y he aprendido cosas muy interesantes, que me han ayudado a tener más claro mi futuro académico y laboral, a lo que me dedicaré y lo que estudiaré durante segundo de bachiller para acceder a la carrera que pienso hacer. Hoy no hemos avanzado mucho en el proyecto, hemos vuelto a hacer un gel (utilizando TAE, RED SAFE ( es un colorante) y agarosa (esta última hacía que el gel se volviese duro)), en el que hemos dejado unos huecos en los que hemos vertido el DNA que hemos obtenido junto a unos colorantes. El gel se metía en un líquido con sales, se le aplicaba una corriente eléctrica durante una media hora, y el DNA viajaba a través del gel desde la zona de carga negativa hacia la zona de carga positiva (recordar que el DNA es ácido desoxirribonucleico, y todos los ácidos tienen carga negativa, por lo que son atraídos por las cargas negativas).

 (electroforesis)

Después, colocamos el gel (con las marcas del viaje del DNA) en una cámara de luz ultravioleta, en la que se podía observar completamente el viaje del DNA y de los colorantes. No hemos podido hacer más.

Durante esa «media hora» que tardaba en hacerse la electroforesis (así se llama al procedimiento de aplicar una corriente eléctrica al gel), aprovechamos para hacer una vuelta por la politécnica y ver las demás instalaciones de biotecnología que había en ésta. Como estas instalaciones (denominadas CAMA, Centro Avanzado de Microbiología de Alimentos) estaba en la otra punta de la politécnica, tardabamos bastante más de una media hora, por eso no tuvimos tiempo de avanzar más en el proyecto.

ULTIMO DÍAAAA  en la politécnica. Hoy realizamos la última parte del protecto: tras haber hecho Gonzalo una PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa, en inglés) de unos microorganismos y haberla mandado al centro de procesador, nos han enviado unas gráficas con los nucleótidos de dicho ADN. Solo tuvimos que, por ordenador, disponer la gráfica en distinto orden y pegar, ya que no es precisa en los extremos, por lo que la disponemos en dos sentidos para obtener una gráfica completa. Aquí confirmé algo que ya sabía, y es que soy malííííííísimo en informática, y en bioinformática también.

 Nada más, nos dispunimos a hacer el vídeo para el polimedia y nos despedimos de los amigos y de Gonzalo (Gonzalo tambien es un amigo XD) lo que siempre da pena, sobre todo despues de haber tenido una experiencia tan agradable. Me ha encantado el Praktikum, tiene muchísmimas cosas positivas (y algunas negativas, como el polimedia) y me siento muy satisfecho de haber participado en esto.

Desde aquí un fuerte abrazo a mis colegas del Praktikum y todas las personas que nos han ayudado en este proyecto.

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Jun 27 2011


Observación de microorganismos Borja

27 de junio de 2011

Empezamos el primer día con una explicación por parte de los profesores de cada grado de la rama agroalimentaria sobre cada uno de los grados así como de su salida laboral. Tambiém nos han entregado una bolsa con una carpeta, un boli, una libreta y una bata para utilizar estos materiales en el laboratorio. Seguidamente, nos han presentado nuestro profesor durante esta semana y a nuestro compañero de proyecto.Después de motrarnos el laboratorio, Gonzalo, nuestro profesor durante la semana en los laboratorios, nos ha hecho una explicación del material de laboratorio, los procedimientos, y las precauciones que tenemos que tomar cada vez que realicemos alguna prueba.

Primero nos explica como funciona el autoclave y otros aparatos. Para todos aquellos que no estén familiarizados con el material de laboratorio, el autoclave es una máquina que augmenta la presión y la temperatura para conseguir una esterilización completa de los materiales introducidos en él. También nos muestra una máquina que absorve los gases y que sirve para manipular substàncias peligrosas, normalmente volátiles, así como otra que renueva y filtra el aire para impedir la contaminación de las muestras. Esta última la utilizaremos para poner nuestras preparaciones en las placas Petri.

Seguido, nos hemos puesto las batas del laboratorio y hemos empezado a preparar nuestra primera preparación para un cultivo de microorganismos. Eso si, en todo momento hemos tomado nota para recordar en cada caso la mejor forma de hacer las cosas y de realizar correctamente la práctica. Para la preparación del cultivo hemos utilizado una base con agar mezclada con agua destilada y que después hemos puesto en el autoclave. Para no utilizar el autoclave solo yo y mi compañero Diego, hemos esperado a que otras compañeras del laboratorio terminaran su preparado y así poner en marcha el autoclave solo una vez. También tengo que decir, que no se nos ha dejado poner en marcha el autoclave a nosotros por razones de seguridad.

A continuación, como la esterilización del preparado tardaría una hora aproximadamente, hemos bajado a una cafetería a tomarnos un zumo y a descansar un rato mientras hablamos con los profesores sobre que nos gustaría hacer dentro de unos años y que sería interesante que estudiaramos durante el próximo curso. Después de este tiempo libre, subimos al laboratorio y Gonzalo nos explica como realizar el cultivo sobre unas placas de cultivo ya preparadas. Después de unos consejos sobre seguridad en los cultivos hemos preparado el material y nos han explicado como debemos esparcir los microorganismos sobre el preparado. Seguido, hemos elegido unos cultivos ya hechos, y hemos realizado la triple estría en las diferentes placas para hacer nuestro cultivo. La triple estría consiste en coger un conjunto de microorganismos de una colonia y realizar unas rayas en el preparado en zig-zag. Después de desinfectar la aguja con el mechero, volvemos a realizar el zig-zag en otra dirección y volvemos a realizar el mismo proceso una vez más. De esta forma conseguimos colonias independientes que proliferan por si solas. Unas de las cosas que más me han impactado de esta parte de la práctica es lo rápido que se calienta la aguja y se pone al rojo vivo, y la extraña textura que tiene el preparado cuando solidifica ya que sin querer he hecho demasiada fuerza en alguna de las estrías y he hecho un pequeño agujero en el preparado. Para terminar los cultivos los hemos cerrado y los hemos puesto en una máquina para mantener su temperatura a 28ºC y de esta forma hacer que crezca el cultivo de forma más rápida.

Seguido, hemos cogido nuestros preparados, que ya habían salido del autoclave y habían estado un rato rebajando su temperatura para poder manipularlos, y los hemos colocado en diferentes placas Petri para que solidificara el preparado. La primera vez estaba un poco nervioso ya que el recipiente estaba caliente, tenía el mechero encendido al lado y tenía miedo de romper algo o de echar el preparado fuera de las placas, pero cuando he llenado dos o tres placas le he cogido confianza y he ido bastante más rápido. El tener un mechero al lado durante las prácticas sirve para alejar el resto de microorganismos del preparado y así impedir la contaminación.

Solo terminar las prácticas, nos hemos labado las manos, proceso fundamental en el laboratorio, y nos han acompañado a comer. Hemos tenido una hora agradable, donde hemos expuesto nuestras opiniones sobre el Praktikum y nos hemos contado nuestras experiencias y proyectos. Después de esto, nos han traido a una clase de informática donde hemos empezado a escribir este blog que en estos momentos redacto.

Para ser el primer día solo me queda decir que ha sido una experiencia increible, y aunque no hemos hecho mucho porque era el primer día, me ha encantado y recomiendo este tipo de prácticas a todo el mundo. Espero que el resto de la semana sea igual o mejor, así que creo que por hoy ya he escrito suficiente y me despido hasta mañana.

Un saludo, Borja Martínez Sinisterra.

28 de junio de 2011:

Hoy cumplo 17 años, y sigo pensando que esta oportunidad de venir al Praktikum 2011 es uno de los mejores regalos que podía recibir. El segundo día de prácticas empieza a las 9 de la mañana cuando entro al Hall de la escuela de Ingenieros Agrónomos y  me encuentro con mi compañero, Diego. Subimos hacia los laboratorios mientras hablamos de como nos fue el día anterior al volver a casa y al llegar a la planta de arriba, pedimos nuestras llaves para las taquillas. Dejamos nuestros objetos, nos ponemos las batas, y cogemos las libretas para no perder detalle de lo que hariamos hoy.

Cuando entramos en el laboratorio,saludamos a Gonzalo, nuestro profesor de prácticas, y nos explica en que va a consistir la práctica de hoy, mientras nos entrega unas hojas con información. La práctica es » Tinción de Gram». Consiste en tintar unas bacterias para poder observarlas ya que estas son casi transparentes. Dependiendo del color que tenga la bacteria después de la tinción, las bacterias se clasificaran en Gram-positivas y en Gram-negativas. Las G+ (Gram-positivas) tienen la pared bacteriana más gruesa que la de las G- (Gram-negativas), por esta razón, al colorear las bacterias y después echar alcohol, las G- perderán todo el color, mientras que las G+ todavía conservaran color. Las Gram-positivas conseguirán un color violeta oscuro y en algunos casos casi negro, mientras que las Gram-negativas tendrán un color rosado.

Primero, echamos una gota de agua sobre un portaobjetos y esparcimos con el asa de siembra unos pocos microorganimos de un cultivo sobre esta gota. Seguido, secamos el agua y pasamos el portaobjetos sobre la llama del mechero de forma rápida para fijar las bacterias. De esta forma habremos completado los pasos de extensión, desecación y fijación.

Ahora vamos a realizar la tinción. Ponemos violeta de Genciana y lo dejamos durante un minuto. Después, quitamos el violeta y ponemos el lugol sin lavar la muestra. Esperamos un minuto y ponemos alcohol para decolorar la muestra. Después de 30 segundos limpiamos el portaobjetos con agua destilada y colocamos sobre este fucsina básica durante 3 minutos. Finalmente solo nos queda lavar y observar al microscopio.

Cuando observamos en el microscopio las dos muestras que hemos hecho, primero con 40 aumentos, vemos que las bacterias forman una acumulación de color oscuro. Por esto, podemos deducir que son Gram-positivos, aunque ya lo sabiamos porque todos los actinomicetos, que son los organimos con los que trabajamos, son G+. Después de ver con el objetivo de 40 aumentos, nos explican como utilizar el objetivo de 100 aumentos ( 1000 aumentos si tenemos en cuenta el aumento de la lente por la que miramos). Para utilizar este objetivo, necesitamos poner una gota de aceite de inmersión en el portaobjetos para que la refracción de la luz no afecte a la imagen. Así que ponemos el aceite y observamos las bacterias.

Para finalizar la práctica hablamos de nuestras observaciones. Vemos que en una de las muestras las bacterias son cocos, es decir, tienen forma redonda, mientras que en la otra son bacilos, son alargados. Después de identificar las bacterias, Gonzalo nos da una muestra para observar en la cual vemos  bacilos Gram-positivos y Gram-negativos ya que es una muestra contaminada.

Después de la práctica de hoy, Gonzalo nos ha dado unas hojas con información para la práctica de mañana, «Extracción de DNA», y un conjunto de hojas con información en inglés sobre la microbiologia. Finalmente esperamos a las compañeras de laboratorio, guardamos las batas y nos vamos a la sala de informática.

Mañana seguiré escribiendo sobre nuestras prácticas y sobre que haremos esta tarde, pero ahora me mandan a comer así que me despido.

Un saludo, Borja Martínez Sinisterra

29 de junio de 2011

Empezaré contando como terminó el día pasado. Después de escribir el blog, comimos en la cafetería la Vella y descansamos una hora. A continuación, nos llevaron a la escuela de Industriales, donde nos dieron una conferencia sobre como hablar en público ya que la semana que viene tenemos que exponer nuestro trabajo en un polimedia para colgarlo en la red.

Ahora, después de haber hablado de como terminamos el martes, contaré que hemos hecho hoy. El día empieza con el encuentro de mi compañero Diego en el Ágora. Subimos al laboratorio, dejamos nuestras pertenencias en las taquillas y nos ponemos las batas como de costumbre. En el laboratorio, empezamos nuestra práctica de hoy que será «Extracción de DNA de bacterias». Primero nos explican que ahora la extracción de DNA es mucho más fácil y rápida ya que tenemos los productos necesarios ya preparados y antiguamente se tenían que preparar en el laboratorio mezclando reactivos. Después de esta aclaración y de ponernos los guantes, preparamos el material. Este será:

  • Kit de extracción de DNA. Contiene los reactivos como la lisozima o la solución para lisiar.
  • Micropipetas. Sirven para coger cantidades muy pequeñas de líquidos.

  • Asa de siembra.
  • Bacterias.
  • Vórtice.
  • Centrifugadora.

Primero hemos cogido unas bacterias con el asa de siembra desinfectada, y las hemos puesto en un tubo. Seguido, ponemos la lisozima, lo metemos en el vórtice unos 15 segundos y lo dejamos durante media hora en una placa eléctica que mantiene su temperatura a 37ºC. Durante esta media hora, yo y Diego hemos aprovechado para almorzar y descansar.

A continuación, hemos subido al laboratorio y hemos puesto un poco de RNAsa. Lo hemos dejado 2 minutos y después hemos puesto con la micropipeta, objeto que hemos utilizado durante todo el proceso, la proteinasa K. Después lo hemos pasado por el vórtice durante 15 segundos y después a la placa para calentar a 55ºC durante 10 minutos.

Seguido, ponemos la preparación de columna dentro de la columna, que es como un frasco pequeño con un material para retener sólidos en el centro,y lo centrifugamos. Ahora ponemos las bacterias en la columna y centrifugamos. Después haremos unos lavados para dejar solo el DNA, y los realizaremos con la centrifugadora. Finalmente pondremos una solución con el DNA en otra columna y lo pondremos en el congelador.

Como nos ha sobrado bastante tiempo, primero hemos estado leyendo los artículos que nos dieron ayer, y después nos han enseñado como hacer el gel para la electroforesis. La electroforesis consistes en poner el DNA en un gel y someterlo a luz ultravioleta para ver si realmente hay DNA en esas muestras. Nos han llevado a otro laboratorio y nos han enseñado como hacerlo.

Después de dejar el gel solidificando y decirnos que mañana seguiremos haciendo la electroforesis, hemos hablado sobre como haremos nuestro polimedia yo y mi compañero. Finalmente nos hemos despedido de Gonzalo y hemos venido a aquí a escribir el blog. Ahora mismo nos vamos a comer así que me despido y sigo informando mañana de como ha ido la electroforesis y nuestra actividad de esta tarde.

Me despido, Borja Martínez Sinisterra.

30 de junio de 2011

Ayer tuvimos una visita guiada por el politécnico, acompañados por Javier, nuestro servipoli. Nos mostró las instalaciones deportivas del campus y nos aconsejó sobre las ventajas de pertenecer al campus de Vera. Después de la visita nos despedimos y nos fuimos a casa.

Hoy el día ha empezado bien ya que estaba un poco nublado y la temperatura no ha sido muy elevada. Como todos los días, hemos subido al laboratorio a las 9:15, hemos dejado la mochila en la taquilla y nos hemos puesto las batas. A continuación, hemos hablado con Gonzalo y nos ha llevado a otro laboratorio para volver a realizar el gel, ahora por nuestra cuenta. Hemos puesto la agarosa con el TAE y lo hemos calentado para fundir la agarosa y que al enfriarse consiguiera un estado sólido. Después, la hemos metido en un molde y lo hemos dejado solidificar. Una vez solidificado, lo hemos metido en una cubeta de electroforesis llena de TAE. En esta cubeta hemos vertido el DNA junto con otro líquido de forma que, debido a su mayor densidad, han caido en unos agujeros que han quedado en el gel gracias al molde. Hemos hecho pasar una corriente eléctrica por la cubeta para desplazar el DNA y poder observarlo después.

Durante el periodo de tiempo que ha durado la electroforesis, nos hemos ido a almorzar y a visitar el C.A.M.A. (Centro Avanzado de Microbiología de Alimentos). Después de andar durante 10 minutos hacia el CAMA, nos han enseñado los laboratorios y algunos de los proyectos que todavía se desarrollan allí. Finalmente hemos vuelto para ver el DNA.

Cuando hemos llegado al laboratorio, Gonzalo ha puesto el gel en una cámara, que emite luz ultravioleta para poder ver el DNA en el gel y los pares de bases que contiene. Este aparato contiene un objetivo que nos permite ver la imagen del gel en una pantalla. Hemos guardado la imagen del DNA y hemos dado por terminadas nuestras prácticas de hoy.

Finalmente, hemos dejado las batas y hemos venido a los ordenadores a escribir el blog, aunque nos han dado un poco de prisa ya que también teniamos que rellenar un formulario. Me despido y mañana cuento como ha ido el último día.

Borja Martínez Sinisterra.

1 de julio de 2011

Hoy es el último día del Praktikum y solo puedo decir que ha sido impresionante. Hemos hecho unas prácticas con el ordenador para seqüenciar y limpiar el DNA de algunos microorganismos. Después de realizar el solapamiento de las cadenas, las hemos pasado al ordenador y con dos programas distintos hemos podido perfeccionar la seqüencia. Seguido, hemos enviado la seqüencia a una base de datos para compararla con el DNA de distintos organismos, y nos ha dicho el género al que pertenece el DNA.

Después de la práctica de bioinformática, hemos hecho unas grabaciones para nuestro polimedia y hemos visto nuestros cultivos del primer día, a los cuales también hemos hecho fotos.

Finalmente, nos hemos despedido de los profesores y hemos intercambiado los correos electrónicos. Después hemos ido a almorzar a la Tarongería y a continuación hemos venido a ecribir por última vez en el blog. Para terminar, solo me queda decir que ha sido un placer trabajar con profesores del centro y realizar estos proyectos que han sido tanto entretenidos como lúdicos. Por esto, recomiendo a la gente que venga aquí los próximos años que haga todo lo posible por ser seleccionado en los siguientes Praktikum ya que es una experiencia única y especial.

Me despido de este blog para siempre, Borja Martínez Sinisterra.

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